Harm Brouwer studeerde Nederlands recht aan de Rijks Universiteit in Leiden en internationale betrekkingen aan de Johns Hopkins University in Bologna, Italië.
Brouwer startte in 1977 zijn loopbaan als bedrijfsjurist bij het bedrijf Philips in Eindhoven, waarna hij van 1988 tot 1992 rechter was bij de Rechtbank in Roermond. Van 1992 tot 1996 werkte Brouwer bij het Gerechtshof Den Haag in de functie van raadsheer, daarna werd hij hoofdofficier van justitie op het Openbaar Ministerie in Leeuwarden. In 1999 werd Harm Brouwer benoemd tot president van de Rechtbank Utrecht. Sinds 2004 is hij Procureur-generaal en vanaf juni 2005 voorzitter van het College van procureurs-generaal.